Épidémie de Salmonella associée à la consommation de saucisses sèches de porc en France, septembre 2020 – janvier 2021

Contexte et identification de l'épidémie

Entre septembre 2020 et janvier 2021, une épidémie d'infections à Salmonella enterica sérotype Bovismorbificans a été constatée en France. Cette épidémie a concerné plusieurs régions françaises et s'est caractérisée principalement par une série de cas groupés dans le temps et l'espace. Les expertises épidémiologiques et microbiologiques ont rapidement ouvert la piste vers un aliment spécifique : les saucisses sèches de porc.

Objectifs de l'enquête épidémiologique

Cette enquête avait pour principal objectif d'identifier la source de l'épidémie à travers une analyse approfondie des cas signalés en lien avec Salmonella enterica Bovismorbificans.

Les équipes de santé publique ont eu pour mission de :

• Identifier rapidement les cas confirmés ou suspects.
• Détecter la source de contamination alimentaire responsable.
• Mettre en œuvre les mesures de contrôle appropriées pour stopper la propagation.

Méthodologie de l'enquête

Étude descriptive

Les données de cas ont été collectées grâce aux déclarations obligatoires des laboratoires d'analyses médicales et par une surveillance renforcée des salmonelloses. Les autorités ont mené des enquêtes auprès des patients afin d'identifier le point commun dans les expositions alimentaires.

Investigation microbiologique et traçabilité

Des isolats bactériens collectés auprès des patients et des produits alimentaires suspects ont été soumis à des analyses génomiques approfondies. Le typage par séquençage génomique entier (WGS) a permis d’établir des liens génétiques précis entre les isolats humains et alimentaires.

Une enquête de traçabilité alimentaire détaillée a été réalisée pour remonter la chaîne de fabrication des saucisses suspectées et identifier précisément les points possibles de contamination dans la chaîne de production.

Résultats de l'enquête : cas humains et source de contamination

Un total de 92 cas confirmés d'infection par Salmonella Bovismorbificans ont été enregistrés dans toute la France. La majorité des infections ont été observées dans la région Auvergne-Rhône-Alpes, mais d'autres cas étaient dispersés sur plusieurs régions.

Les investigations microbiologiques et environnementales ont rapidement identifié les saucisses sèches de porc comme dénominateur commun entre tous les cas recensés. La présence de Salmonella a été confirmée sur des échantillons alimentaires issus de plusieurs lots de saucisses sèches de porc produits par un même fabricant français.

Le typage génomique (WGS) a en effet révélé une étroite similitude génétique entre les isolats humains et ceux des échantillons alimentaires, confirmant définitivement la source de l'infection.

Mesures d'intervention et prévention

Immédiatement après l'identification de la source alimentaire, plusieurs mesures de contrôle ont été prises :

• Retrait immédiat du marché des saucisses sèches contaminées.
• Rappel auprès des consommateurs des produits potentiellement infectés déjà commercialisés.
• Fermeture provisoire et assainissement de l'unité productrice.
• Renforcement des mesures d'hygiène et des plans HACCP dans l'usine concernée.

Suite à ces interventions rapides, aucun nouveau cas lié à cette épidémie n’a été signalé après janvier 2021.

Discussions et enseignements tirés

Cette épidémie a permis de souligner plusieurs points essentiels dans la gestion des crises alimentaires :

• Importance d'une surveillance rapide et réactive de la salmonellose par détection rapide des clusters.
• Nécessité des méthodes moléculaires comme le séquençage complet du génome (WGS) pour une identification précise et rapide des souches impliquées, permettant une meilleure réactivité face à une crise.
• Urgence de sensibiliser tant les producteurs alimentaires que les consommateurs sur les bonnes pratiques de manipulation, conservation et consommation des aliments secs fermentés de type charcuterie qui ne sont pas destinés à être consommés cuits.

L'expérience acquise pendant cette enquête a également permis d'améliorer la communication entre acteurs du système de sécurité alimentaire français afin d’assurer une réponse coordonnée efficace lors de futures crises sanitaires.

Conclusion

Cette investigation a efficacement permis d'identifier les saucisses sèches comme cause de l'épidémie de Salmonella enterica Bovismorbificans en France. Grâce à une réaction rapide des autorités sanitaires et à l'emploi rigoureux des méthodes de pointe telles que le WGS, un contrôle rapide de la contamination et de l’épidémie a été assuré. Ces événements soulignent à quel point la réactivité, couplée à des outils analytiques puissants, est essentielle afin de limiter l'impact d'une contamination alimentaire.

Source : https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2023.28.2.2200123