Interconnexions entre le système alimentaire et la résistance aux antimicrobiens : Perspective Une seule santé (étude canadienne)

Introduction

La résistance aux antimicrobiens (RAM) représente un défi sanitaire mondial multifactoriel, remettant en question la santé humaine, animale et l’intégrité environnementale. L'approche Une seule santé, qui intègre les dimensions humaines, animales et environnementales, permet une compréhension exhaustive des dynamiques de la RAM au sein du système alimentaire. Cette synthèse examine les principaux points de contact entre le système alimentaire canadien et la propagation de la RAM, en mettant l'accent sur les mécanismes empruntés, les secteurs les plus exposés et les stratégies d'atténuation efficaces.

Mécanismes de transmission de la RAM dans le système alimentaire

Des bactéries résistantes aux antimicrobiens émergent et se propagent à l’interface de multiples environnements du système alimentaire. Ces bactéries et leurs gènes résistants transitent à travers les animaux d’élevage, les cultures, l’eau d’irrigation et les humains impliqués, notamment via :

• Usage vétérinaire des antimicrobiens dans les fermes pour la prévention et le traitement des maladies animales, favorisant la sélection de souches résistantes.
• Applications phytosanitaires où les effluents d'élevage contaminés servent d'engrais ou d'amendement organique, favorisant la dissémination de bactéries et de gènes de résistance dans les sols et l'eau d'irrigation.
• Chaîne de transformation alimentaire : de l’abattage à la distribution, chaque étape est une occasion de contamination croisée par des agents pathogènes résistants.
• Consommation humaine : les produits alimentaires contaminés peuvent véhiculer des agents hautement résistants, aggravant le fardeau de la RAM dans la population.

Spécificités canadiennes : panorama sectoriel

Au Canada, l’élevage intensif (bovins, porcins, volailles) fait un usage considérable d’antibiotiques pour stimuler la croissance et prévenir les maladies. Les analyses du contenu bactérien résistant dans les denrées animales révèlent l’enracinement du phénomène au sein des filières agroalimentaires locales.

Des données récentes montrent que les filières agricoles sont confrontées à la dispersion de la RAM en raison de la dispersion environnementale d’excréments animaux, qui contiennent une diversité de bactéries résistantes et de gènes associés. Ces agents circulent alors par ruissellement, contaminateurs des bassins hydrographiques et systèmes d'irrigation agricole.

Chemins d'exposition et risques pour la santé publique

• Consommation de viande insuffisamment cuite
• Contact avec des produits frais irrigués par une eau contaminée
• Manipulation d’aliments bruts dans les cuisines industrielles et domestiques

Chez l’humain, la RAM acquise par ingestion directe ou indirecte peut entraîner des infections difficiles à traiter, une augmentation de la morbidité, de la mortalité, et une pression accrue sur les systèmes de santé.

Interactions entre animaux, environnement et humains

L’environnement joue un rôle central comme réservoir et vecteur des agents de la RAM. Les sols fertilisés par le fumier, les systèmes aquatiques recevant des effluents agricoles et les écosystèmes affectés par l’épandage de pesticides — enrichis en antimicrobiens — structurent la géographie de la résistance microbienne.

Les travailleurs agricoles, exposés de façon chronique à la manipulation de produits animaux ou végétaux contaminés, présentent une prévalence accrue de bactéries résistantes dans leur microbiote commensal. Cette dynamique favorise la circulation bidirectionnelle de résistances entre la communauté agricole et la population urbaine via le réseau alimentaire.

Stratégies intégrées de surveillance et d’atténuation

Pour faire face à la RAM, le Canada a mis en œuvre plusieurs dispositifs de surveillance et des mesures de réduction de l’usage des antimicrobiens dans l’agriculture :

• Programmes nationaux de surveillance : Suivi régulier des souches bactériennes résistantes dans les élevages, les produits alimentaires et l’environnement
• Politiques de réduction de l’utilisation des antibiotiques chez les animaux : Encadrement des prescriptions vétérinaires, restriction des ventes sans ordonnance, promotion des alternatives préventives (vaccination, biosécurité accrue)
• Gestion environnementale : Traitement efficace des effluents d’élevage, adoption de bonnes pratiques agricoles visant à limiter la dissémination de la RAM dans les sols et les voies aquatiques

Rôle de la communication et des approches transdisciplinaires

Un dialogue constant entre les secteurs agricole, vétérinaire, médical et environnemental est indispensable. La sensibilisation des producteurs, des détaillants et des consommateurs, combinée à la recherche participative, favorise l’adoption de pratiques collectives de réduction de la résistance.

Innovations et perspectives futures

L'analyse génomique des souches bactériennes, le développement d'outils de dépistage rapide, l'amélioration des modèles prédictifs et la promotion d’élevages alternatifs figurent parmi les axes stratégiques de recherche. Investir dans ces innovations permettrait d'intervenir précocement dans le cycle de propagation et de limiter l’émergence de nouvelles souches résistantes.

Conclusion

La RAM, issue des interconnexions complexes entre production alimentaire, médecine vétérinaire, environnement et mode de vie, nécessite impérativement une approche Une seule santé ancrée dans la surveillance, la prévention, la réduction des usages inappropriés et l’innovation. Au Canada, la mobilisation concertée de tous les acteurs du système alimentaire constitue la seule voie de résilience durable face à cette menace croissante.

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Source : https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235277142500179X?dgcid=rss_sd_all