Sources et stratégies de contrôle des mycotoxines d’Alternaria alternata

Alternaria alternata est un champignon filamenteux ubiquiste qui affecte un vaste éventail de cultures agricoles à travers le monde. Connu pour la production de mycotoxines nocives, il constitue un enjeu de sécurité alimentaire et de santé publique majeur. Cet article examine la diversité des sources de contamination par Alternaria alternata, les voies d'exposition aux mycotoxines, et les stratégies de contrôle actuelles et émergentes visant à minimiser les risques associés.

Introduction

Alternaria alternata, membre des Deuteromycètes, est l’un des pathogènes les plus répandus dans les milieux agricoles et post-récolte. Sa capacité à synthétiser diverses mycotoxines, en particulier les toxines alternariol (AOH), alternariol monométhyl éther (AME), tétralone, tétralenone (TE), altériène (ALT), et d’autres métabolites, en fait un agent de risque élevé tant pour les denrées alimentaires que pour les aliments pour animaux. Les maladies associées aux métabolites d’Alternaria comprennent diverses formes de toxicité cellulaire, d’immunosuppression et de génotoxicité.

Origine et distribution des mycotoxines d’Alternaria alternata

Présence sur les cultures

A. alternata est essentiellement présent sur les fruits et légumes : tomates, blé, tournesol, agrumes, fruits rouges, pommes, oignons et bien d’autres cultures enregistrent fréquemment des contaminations. La contamination peut survenir aussi bien sur le champ que durant les phases de stockage, surtout si les conditions de température et d’humidité sont favorables au développement fongique.

Voies d’infection et facteurs favorisants

La contamination peut être primaire (sur la plante vivante) ou secondaire (après récolte lors du stockage ou du transport). Les facteurs déterminants incluent :

• Humidité : Un taux élevé favorise la germination et la croissance du champignon.
• Température : Alternaria alterne préfère les températures modérées, avec un optimum entre 20°C et 30°C.
• Altérations mécaniques ou physiologiques des végétaux : Les blessures et le stress de la plante facilitent l’envahissement.
• Conditions de stockage inadaptées : Des locaux chauds et humides après récolte exacerbent la production de toxines.

Voies d’exposition humaine et animale

Les expositions humaines et animales proviennent principalement de l’ingestion d’aliments contaminés. Les mycotoxines d’Alternaria sont fréquemment détectées dans les produits céréaliers, les jus, sauces, conserves, et dans l’alimentation des animaux. L’exposition par voie respiratoire, bien que secondaire, peut également survenir dans des environnements très contaminés, notamment dans des silos ou lors du traitement de végétaux infestés.

Toxicité et risques sanitaires

Les mycotoxines produites, en particulier AOH et AME, présentent une génotoxicité et peuvent provoquer un stress oxydatif cellulaire. Leur implication potentielle dans des troubles immunitaires, des maladies hépatiques ou rénales, ainsi qu’un rôle suspecté dans certains processus carcinogènes, nécessitent une vigilance accrue dans la gestion de leur présence dans la chaîne alimentaire.

Stratégies de contrôle et de réduction des mycotoxines d’Alternaria alternata

Bonnes pratiques agricoles (BPA)

La première ligne de défense contre la contamination est le respect strict des bonnes pratiques agricoles :

• Choix de variétés résistantes
• Gestion intégrée des cultures (rotation, lutte biologique)
• Optimisation de l’irrigation pour éviter l’humidité excessive
• Surveillance et traitement rapide des maladies et parasites

Optimisation des pratiques post-récolte

Le séchage rapide, une ventilation adéquate des stocks, le contrôle précis de l’humidité et de la température pendant le stockage sont essentiels pour prévenir la prolifération fongique. Le tri et l’élimination des fruits ou grains abîmés réduisent la charge initiale en toxines.

Application de fongicides et alternatives biologiques

Si l’utilisation de fongicides reste autorisée pour certaines cultures, de nouvelles approches se développent pour minimiser l’usage de produits chimiques :

• Traitements biologiques : Utilisation de bactéries ou de levures antagonistes pour inhiber le développement d’Alternaria.
• Extraits végétaux : Certains extraits naturels présentent une activité antifongique équilibrée, offrant de nouvelles pistes de traitement.
• Traitements physiques : Méthodes telles que l’irradiation, le traitement thermique ou par plasma ont montré un impact sur la réduction de la viabilité fongique et de la production de toxines.

Détection et suivi analytique

La détection rapide et précise des toxines par chromatographie liquide à haute performance (HPLC), spectrométrie de masse et d’autres techniques de pointe est indispensable pour évaluer et contrôler la contamination. Le développement de kits de diagnostic rapide et de méthodes in situ améliore la capacité d’intervention sur le terrain.

Perspectives de recherche et recommandations

L’intégration de systèmes de suivi numérique, d’intelligence artificielle et de biotechnologies pourrait révolutionner la gestion des risques liés à Alternaria alternata. Les travaux de recherche se poursuivent autour de la compréhension des génomes fongiques, de leur mécanisme de résistance et d’adaptation, et de la modulation de la biosynthèse des toxines par des facteurs abiotiques et biotiques.

Une approche multidisciplinaire, impliquant agronomes, hygiénistes, toxicologues et industriels, reste essentielle pour limiter efficacement l’impact des mycotoxines d’Alternaria alternata sur la santé publique et les filières agroalimentaires.

Source : https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0924224426000440?dgcid=rss_sd_all