Perspectives génomiques et approche One Health sur Clostridium perfringens entérotoxigène dans les coquillages de vente au détail : Preuves d'une circulation environnementale et zoonotique

Introduction

La contamination des coquillages par Clostridium perfringens entérotoxigène pose un enjeu de santé publique majeur en raison du potentiel zoonotique et des risques alimentaires associés. Une analyse approfondie, s’appuyant sur le séquençage génomique, révèle l’étendue de la circulation environnementale et la transmission possible de ce pathogène via les produits de la mer, nécessitant une vigilance accrue selon les principes One Health.

Caractéristiques génomiques de Clostridium perfringens

Clostridium perfringens, bactérie anaérobie sporulée omniprésente dans les sols, eaux marines et le tube digestif de nombreux animaux, est responsable de toxi-infections entériques d’origine alimentaire, notamment à travers la production d’entérotoxines. L’étude génomique des souches isolées de coquillages commercialisés démontre une diversité génétique importante :

• Présence de plasmides porteurs de gènes d’entérotoxines (cpe)
• Variabilité dans les déterminants de virulence et d’adaptation environnementale
• Homologie partielle avec des isolats cliniques humains et animaux

Ce spectre génétique suggère une interconnectivité des sources environnementales et zoonotiques, favorisée par les flux hydriques et les interfaces animal-homme-environnement.

Méthodologies et données moléculaires

L’approche adoptée inclut :

• Séquençage du génome entier (WGS) pour une cartographie complète des déterminants de virulence
• Typage des gènes cpe et surveillance de leur localisation chromosomique vs plasmidique
• Analyse comparative avec des bases de données internationales d’isolats humains, vétérinaires et environnementaux

Les résultats mettent en évidence des profils génétiques partagés entre les souches issues de coquillages et celles d’origines humaine et animale, démontrant la plasticité de C. perfringens et ses capacités adaptatives via transfert horizontal de gènes.

Preuves de circulation environnementale et zoonotique

Les similitudes génétiques significatives pointent vers une circulation réciproque entre écosystèmes aquatiques, animaux réservoirs et populations humaines. Les coquillages fonctionnent comme bioaccumulateurs, amplifiant le risque de transmission alimentaire.

Facteurs renforçant la transmission :

• Contamination de l’eau de mer par effluents domestiques et industriels
• Prévalence plus élevée des souches entérotoxigènes dans les échantillons de vente au détail que dans d’autres matrices alimentaires
• Survie prolongée des spores dans les environnements aquatiques

Ces observations soulignent que la gestion du risque Clostridium perfringens ne peut s’envisager qu’à l’échelle globale One Health, impliquant secteur agroalimentaire, environnemental et de santé humaine.

Approche One Health : vers une meilleure surveillance

La perspective One Health prône l’intégration des données issues de l’environnement, de la santé animale et humaine pour anticiper les émergences zoonotiques. Dans ce contexte :

• Renforcement des réseaux de surveillance génomique des coquillages et des environnements côtiers
• Collaboration multidisciplinaire entre microbiologistes, épidémiologistes et gestionnaires de la sécurité alimentaire
• Développement de protocoles rapides de détection et de génotypage dans la chaîne de production et de commercialisation des produits de la mer

L’application de ces leviers doit permettre d’identifier précocement les souches pathogènes émergentes et d’interrompre les chaînes de transmission interspécifiques.

Implications pour la santé publique et recommandations

La consommation de coquillages contaminés par C. perfringens entérotoxigène représente une source non négligeable de gastro-entérites d’origine alimentaire. Les conséquences sanitaires sont amplifiées par la capacité de certaines souches à échanger des gènes de virulence et à survivre dans des conditions hostiles.

Il est recommandé :

• D’optimiser les traitements post-récolte (ex : purification, cuisson)
• De surveiller systématiquement la prévalence du gène cpe dans les lots commerciaux
• D’actualiser les référentiels réglementaires sur la sécurité sanitaire des coquillages au regard des nouvelles données génomiques

Perspectives de recherche futures

Les travaux génomiques ouvrent la voie à l’identification de marqueurs spécifiques de virulence, utiles pour le diagnostic rapide en cas de toxi-infection alimentaire. L’exploration des interactions entre C. perfringens et le microbiote marin apporte également des pistes d’intervention innovantes pour réduire l’accumulation de spores dans les chaînes trophiques.

La compréhension des dynamiques évolutives de C. perfringens entérotoxigène reste une priorité afin de mieux anticiper les risques émergents liés à la globalisation des échanges de produits de la mer et aux changements environnementaux.

Source : https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0956713526000484?dgcid=rss_sd_all