Profils des Gènes de Toxines et Résistance aux Antibiotiques de Clostridium perfringens chez les Animaux de Production Alimentaire : Enjeux pour la Sécurité Sanitaire des Aliments

Introduction

Clostridium perfringens est un pathogène bactérien d'importance mondiale, responsable de nombreuses maladies humaines et animales, incluant les intoxications alimentaires. Cette étude analyse en profondeur la distribution des gènes codant pour les toxines et les profils de résistance aux antibiotiques de souches de C. perfringens isolées d’animaux de rente, soulignant les risques émergents pour la chaîne alimentaire et la santé publique.

Méthodologie

• Sources d’isolats : Échantillons collectés auprès de volailles, bovins et porcs.
• Identification : Confirmation de l’espèce via PCR et séquençage spécifique.
• Profilage génétique : Recherche des gènes des toxines majeures (cpa, cpb, etx, iap, cpe, netB).
• Antibiorésistance : Évaluation de la sensibilité à un panel d’antibiotiques courants (tétracyclines, β-lactamines, macrolides…) par méthode de diffusion en milieu solide et PCR pour la détection des gènes de résistance.

Résultats

Fréquence des gènes de toxines

• Le gène cpa (toxine alpha) a été détecté dans la quasi-totalité des échantillons.
• Les gènes cpb (toxine beta), etx (toxine epsilon) et iap (toxine iota) sont présents à des fréquences moindres et varient selon l’espèce animale. Par exemple, la toxine beta est prédominante chez les porcs, tandis que la toxine epsilon domine chez les ovins.
• Le gène cpe (toxine entérotoxique), impliqué dans les toxi-infections alimentaires humaines, est retrouvé dans une proportion significative de souches isolées de volailles, renforçant la menace pour la sécurité alimentaire.
• Le gène netB, associé à l'entérite nécrotique aviaire, est majoritairement détecté chez les isolats de volaille.

Profils d'antibiorésistance

• Prévalence élevée de résistance à la tétracycline, à l’érythromycine et à la lincomycine, mettant en évidence une forte pression de sélection due à l'usage massif de ces antibiotiques dans les filières animales.
• Les gènes de résistance tet(M), erm(B) et lnu(A) sont fréquemment identifiés, confirmant une résistance multigénique.
• De nombreux isolats montrent un phénotype multirésistant, compatible avec le transfert horizontal de gènes de résistance via des éléments génétiques mobiles.
• Certains isolats présentent encore une sensibilité à la pénicilline G, l’ampicilline et la métronidazole, suggérant que ces molécules restent des options thérapeutiques viables.

Implications pour la Sécurité des Aliments

• La présence cumulée des gènes cocaractérisant les principales toxines et de multiples déterminants d’antibiorésistance implique un risque accru de contamination des denrées animales.
• Le passage de C. perfringens de l’animal à l’homme via les produits alimentaires constitue un enjeu critique pour la santé publique, notamment dans les contextes où la surveillance antimicrobienne et les pratiques d’hygiène sont insuffisantes.
• L’identification des profils multirésistants suggère la nécessité d’une gestion raisonnée des antibiotiques vétérinaires et d’un renforcement des politiques de biosécurité.
• Un suivi systématique des souches en chaîne agroalimentaire améliorerait la compréhension des dynamiques de dissémination et participerait à maîtriser les risques de toxi-infections collectives.

Recommandations

• Limiter l’usage des antibiotiques critiques en prophylaxie animale pour réduire la sélection de souches résistantes.
• Renforcer les mesures d’hygiène dans les élevages et abattoirs afin de limiter la dissémination de C. perfringens.
• Établir des programmes de surveillance intégrée ciblant à la fois le cheptel, la chaîne de transformation et les produits finis.
• Encourager le développement d’alternatives aux antibiotiques, telles que vaccins, probiotiques ou nouvelles molécules antimicrobiennes.
• Éduquer les professionnels du secteur agroalimentaire et de la santé vétérinaire aux enjeux de l’antibiorésistance et des conséquences zoonotiques de C. perfringens.

Conclusion

Les données sur les profils de toxine et la résistance antimicrobienne de C. perfringens issues des animaux d’élevage démontrent une menace tangible pour la sécurité sanitaire des aliments. L’exigence d’une approche intégrée «One Health» se confirme tant dans la gestion de la résistance que dans la prévention des risques alimentaires, imposant une collaboration étroite entre vétérinaires, microbiologistes, responsables de la sécurité alimentaire et autorités de santé publique.

Source : https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2665927126001607?dgcid=rss_sd_all